Em uma era onde luz e trevas travam batalhas há milênios, Yuki, um jovem promissor da Academia de Magia, descobre que carrega dentro de si o poder e as memórias da Primeira Luz, uma entidade celestial destinada a proteger o mundo das forças malignas. Com a ameaça das trevas crescendo, Yuki e seus amigos — Sofhia, Harry, Elizabeth, e Leo — são forçados a lutar pela sobrevivência da academia e de todos que amam.
Os eventos se desenrolam quando Mark, um respeitado professor da academia, revela-se sob o controle de um demônio das trevas. A academia é atacada por monstros e magos das trevas, e os estudantes e professores são obrigados a enfrentar inimigos que ameaçam destruir tudo ao seu redor. Em meio à confusão, Yuki é o único capaz de restaurar a barreira de luz que protege a academia, mas a tarefa o deixa gravemente ferido e exausto.
Enquanto seus amigos travam batalhas ferozes contra os inimigos que se aproximam, Yuki é confrontado por sua verdadeira natureza. Ele é não apenas um mago talentoso, mas a reencarnação da Primeira Luz, um ser divino criado para combater as Trevas Primordiais. Com a ajuda de Apolo, o deus da luz, Yuki começa a recuperar fragmentos de suas vidas passadas, o que o prepara para os desafios futuros.
Após restaurar a barreira, Yuki se vê em uma batalha mortal contra Mark, que é revelado como estando sob controle de um demônio das trevas. A luta culmina com Yuki manifestando o poder do sol e quase derrotando Mark, até que o demônio que controlava o professor revela sua verdadeira forma, intensificando o conflito.
Com cada personagem enfrentando batalhas desesperadas — Elizabeth contra a maga das águas Milt, Leo em uma luta mortal contra o mago da terra Marco, e Sofhia ao lado da Rainha dos Espíritos de Vento contra magos das trevas —, o destino da academia pende por um fio. No fim, os aliados se reúnem para auxiliar Yuki, mas a batalha final contra o demônio traz revelações sobre as vidas passadas de Yuki e o retorno de uma ameaça primordial.
Enquanto Yuki luta para reunir suas forças e impedir o retorno das trevas, Marco e o demônio recuam, prometendo que essa batalha não é o fim. Com a academia em ruínas e seus aliados feridos, Yuki desmaia exausto após erguer uma nova barreira de luz, deixando todos preocupados com seu destino. Ele acorda em um lugar desconhecido, e Apolo o leva ao passado para mostrar-lhe os segredos de sua origem, preparando-o para enfrentar as trevas que estão por vir.
Agora, com fragmentos de suas memórias antigas retornando, Yuki sabe que a luta contra as trevas está longe de terminar, e o verdadeiro teste de sua força e identidade está apenas começando.